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nb de genes


shyiro

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shyiro Membre 15 609 messages
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Zea mais (maïs) 5 000 54 60611
Mus musculus (souris) 3 400 30 000
Homo sapiens (homme) 3 400 26 517

Comment expliquer que le mais a 54606 genes different pour une taille totale de 5000 alors que l'humain n'a que 26517 genes different pour une taille totale de 3400 ?

C'est visible que le mais a moins de matieres differentes / moins de complexités  que l'humain, non ? 

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Membre, scientifique, Posté(e)
Répy Membre 24 356 messages
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il y a 37 minutes, shyiro a dit :
Zea mais (maïs) 5 000 54 60611
Mus musculus (souris) 3 400 30 000
Homo sapiens (homme) 3 400 26 517

Comment expliquer que le mais a 54606 genes different pour une taille totale de 5000 alors que l'humain n'a que 26517 genes different pour une taille totale de 3400 ?

C'est visible que le mais a moins de matieres differentes / moins de complexités  que l'humain, non ? 

Tu n'as pas pris les cas extrêmes : le rosier ou la vigne sont bien davantage pourvus que l'homme.

La taille du génome n'est pas proportionnelle à la taille de l'individu !

De plus dans le génome humain et celui des autres espèces terrestres, plus du quart des gènes appartiennent déjà à des virus marins !

Le génome est une bibliothèque "redondante" où il y a plusieurs possibilités de fabriquer telle ou telle protéine. Certaines de ces possibilités sont contrôlées par des "super gènes" qui sont soit au repos soit actifs. Leur activation dépend de facteurs extérieurs imprévisibles mais ces super gênes sont déterminants. Ils expliquent le passage rapides des mammifères à leu retour à la mer ( dauphins, baleines) d'autres à la perte des pattes pour donner les serpents à l'ère tertiaire. Peut-être aussi le passage des grands singes à l'homme.

Tiens, pour compléter va lire   Le génome de l’ornithorynque !

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shyiro Membre 15 609 messages
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il y a une heure, Répy a dit :

Tu n'as pas pris les cas extrêmes : le rosier ou la vigne sont bien davantage pourvus que l'homme.

La taille du génome n'est pas proportionnelle à la taille de l'individu !

De plus dans le génome humain et celui des autres espèces terrestres, plus du quart des gènes appartiennent déjà à des virus marins !

Le génome est une bibliothèque "redondante" où il y a plusieurs possibilités de fabriquer telle ou telle protéine. Certaines de ces possibilités sont contrôlées par des "super gènes" qui sont soit au repos soit actifs. Leur activation dépend de facteurs extérieurs imprévisibles mais ces super gênes sont déterminants. Ils expliquent le passage rapides des mammifères à leu retour à la mer ( dauphins, baleines) d'autres à la perte des pattes pour donner les serpents à l'ère tertiaire. Peut-être aussi le passage des grands singes à l'homme.

Tiens, pour compléter va lire   Le génome de l’ornithorynque !

Il est tout de meme etonnant que ce sont certains vegetaux qui ont le nb de genes les plus elevés ... alors que leur corps ont beaoucoup moins de proteines different que les animaux ...

Qu'il y ait des genes qui ne sont pas exprimés est une chose, mais pourquoi donc certains vegetaux ont immensement plus de genes non exprimés / nb de genes total que n'importe quel animal ? A quoi sert d'avoir immensement plus de genes total alors qu'ils en expriment immensement moins ?     

 

 

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Pierrot89 Membre 9 216 messages
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Peut être que les végétaux sont immobiles et doivent avoir plus de ressources pour s'adapter aux prédateurs, climat, environnement (le mouton est le prédateur de l'herbe) alors que l'animal est mobile et peut s'enfuir (la gazelle fuit le lion)...

 

Hypothèse non étayée !

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Répy Membre 24 356 messages
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Il y a 10 heures, shyiro a dit :

Il est tout de meme etonnant que ce sont certains vegetaux qui ont le nb de genes les plus elevés ... alors que leur corps ont beaoucoup moins de proteines different que les animaux ...

Qu'il y ait des genes qui ne sont pas exprimés est une chose, mais pourquoi donc certains vegetaux ont immensement plus de genes non exprimés / nb de genes total que n'importe quel animal ? A quoi sert d'avoir immensement plus de genes total alors qu'ils en expriment immensement moins ?     

 

 

Ce sont les hybridations en cascade qui en sont la cause.

De plus  les plantes ont développé une foule de substances toxiques pour se défendre contre de multiples envahisseurs ou bien pour communiquer entre-elles.

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shyiro Membre 15 609 messages
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il y a 2 minutes, Répy a dit :

Ce sont les hybridations en cascade qui en sont la cause.

De plus  les plantes ont développé une foule de substances toxiques pour se défendre contre de multiples envahisseurs ou bien pour communiquer entre-elles.

On pourrait dire que ces vegetaux seraient tellement anciens (ou leur rythme de fecondation/hybridation seraient extremement rapide ?) qu'ils ont subi tellement plus d'hybridation augmentant ainsi immensement leur nb de gene ? Est-ce vraiment le cas ? Le rosier, la vigne et le mais seraient ils vraiment beaucoup plus ancien que d'autres vegetaux ou animal qui ont beaucoup moins de nb de gene ? 

 

J'ai quand meme du mal à penser que le nb de substances que ces vegetaux peuvent emettre, depasse le nb de substances (hormones ...) et d'organes des animaux ... 

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Membre, scientifique, Posté(e)
Répy Membre 24 356 messages
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La complexité du monde végétal vaut bien celle du monde animal !

Par ailleurs la multiplicité des gènes des plantes cultivées découle en partie des sélections humaines et donc "récentes" dans l'histoire du végétal

 

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Membre, 153ans Posté(e)
chanou 34 Membre 25 956 messages
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Il y a 13 heures, shyiro a dit :
Zea mais (maïs) 5 000 54 60611
Mus musculus (souris) 3 400 30 000
Homo sapiens (homme) 3 400 26 517

Comment expliquer que le mais a 54606 genes different pour une taille totale de 5000 alors que l'humain n'a que 26517 genes different pour une taille totale de 3400 ?

C'est pas le génome qu'il faut regarder, mais le transcriptome et le proteome. Le génome n'est qu'une petite partie de l'explication de la complexité ou pas d'un organisme.

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shyiro Membre 15 609 messages
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il y a 6 minutes, chanou 34 a dit :

C'est pas le génome qu'il faut regarder, mais le transcriptome et le proteome. Le génome n'est qu'une petite partie de l'explication de la complexité ou pas d'un organisme.

mais ça ne change pas à la question : pourquoi certains vegetaux qui n'ont qu'un nb limité de proteines fabriqués dans leur organisme, ont un nb de genes total (donc des proteines non fabriqués) immensement élévés comparé aux animaux qui ont un nb de proteines fabriqués/exprimés bien plus nombreux dans leur organisme ? 

(Repy a donné un element de reponse) 

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Membre, scientifique, Posté(e)
Répy Membre 24 356 messages
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Il y a 11 heures, shyiro a dit :

mais ça ne change pas à la question : pourquoi certains vegetaux qui n'ont qu'un nb limité de proteines fabriqués dans leur organisme, ont un nb de genes total (donc des proteines non fabriqués) immensement élévés comparé aux animaux qui ont un nb de proteines fabriqués/exprimés bien plus nombreux dans leur organisme ? 

(Repy a donné un element de reponse) 

Il ne faut pas sous estimer la quantité de protéines dans les végétaux. De plus le code génétique ne code pas que les protéines ! en particulier chez les végétaux il y a une foule de molécules complexes qui interviennent dans la photosynthèse, la fabrication de la cellulose ou de la lignine ou des multiples pigments spécifiques....

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shyiro Membre 15 609 messages
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il y a 5 minutes, Répy a dit :

Il ne faut pas sous estimer la quantité de protéines dans les végétaux.

De plus le code génétique ne code pas que les protéines ! en particulier chez les végétaux il y a une foule de molécules complexes qui interviennent dans la photosynthèse, la fabrication de la cellulose ou de la lignine ou des multiples pigments spécifiques....

Concernant les differents types de proteines fabriqués, j'ai du mal à le concevoir : les vegetaux n'ont ni coeur, ni foie, ni estomac, ni cerveau, ni nerfs, ni sucs digestifs, ni neurones, ni sang, etc ... Il suffit de regarder et decouper un vegetal pour voir que leur matiere est beaucoup moins heterogene que chez les animaux, non ? 

Concernant les genes "non codantes" (= ne codant pas la fabrication d'une proteine), oui j'ai appris recemment que dans la zone appelée habituellement "zone/gene non codante" , on a decouvert la presence des genes tres utiles qui servent à activer ou desactiver tel ou tel gene codant à tel ou tel stade de croissance, ou selon l'environnement ...

Concernant les genes codantes de proteines mais non exprimés, malgré l'hypothese assez interessant suggéré par Pierrot89 pour leur besoin d'adaptabilité pour leur survie, j'ai aussi du mal à concevoir que les vegetaux ont une adaptabilité extremement plus varié que les animaux. Ils peuvent survivre à une secheresse ... il y a des oeufs d'animaux qui en sont capable aussi ... Ils ont besoin de fabriquer des substances pour leurs defenses, les animaux aussi ... j'ai du mal à concevoir que l'equivalent du "systeme immunitaire vegetal" est plus complexe et plus varié que  le systeme immunitaire animal ... 

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Membre, scientifique, Posté(e)
Répy Membre 24 356 messages
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Il y a 11 heures, shyiro a dit :

Concernant les differents types de proteines fabriqués, j'ai du mal à le concevoir : les vegetaux n'ont ni coeur, ni foie, ni estomac, ni cerveau, ni nerfs, ni sucs digestifs, ni neurones, ni sang, etc ... Il suffit de regarder et decouper un vegetal pour voir que leur matiere est beaucoup moins heterogene que chez les animaux, non ? 

Concernant les genes "non codantes" (= ne codant pas la fabrication d'une proteine), oui j'ai appris recemment que dans la zone appelée habituellement "zone/gene non codante" , on a decouvert la presence des genes tres utiles qui servent à activer ou desactiver tel ou tel gene codant à tel ou tel stade de croissance, ou selon l'environnement ...

Concernant les genes codantes de proteines mais non exprimés, malgré l'hypothese assez interessant suggéré par Pierrot89 pour leur besoin d'adaptabilité pour leur survie, j'ai aussi du mal à concevoir que les vegetaux ont une adaptabilité extremement plus varié que les animaux. Ils peuvent survivre à une secheresse ... il y a des oeufs d'animaux qui en sont capable aussi ... Ils ont besoin de fabriquer des substances pour leurs defenses, les animaux aussi ... j'ai du mal à concevoir que l'equivalent du "systeme immunitaire vegetal" est plus complexe et plus varié que  le systeme immunitaire animal ... 

Tu as tout à fait le droit d'avoir cette opinion.

Cependant la complexité biochimique et génétique des différents règnes du vivants : champignons, végétaux et animaux est toujours très grande et sans hiérarchie formelle !

Il faut évacuer ces croyances anciennes plus ou moins bibliques qui placent l'homme sur le dessus de la pile à seule fin de la glorifier. Ce péché d'orgueil est contredit par la science !

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shyiro Membre 15 609 messages
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il y a 4 minutes, Répy a dit :

Tu as tout à fait le droit d'avoir cette opinion.

Cependant la complexité biochimique et génétique des différents règnes du vivants : champignons, végétaux et animaux est toujours très grande et sans hiérarchie formelle !

Il faut évacuer ces croyances anciennes plus ou moins bibliques qui placent l'homme sur le dessus de la pile à seule fin de la glorifier. Ce péché d'orgueil est contredit par la science !

Je suis athée ... je ne parle pas de hierarchie, ni meme de complexité, mais du nb d'heterogenité des matieres dans un organisme ... Comme je l'ai dejà dit : il suffit de ragarder et meme couper en deux un maïs et un poulet, pour constater que la matiere constituant le maïs a beaucoup moins d'heterogeneité que la matiere constituant le poulet, non ? Et c'est une realité, pas une croyance, non ?

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Membre, scientifique, Posté(e)
Répy Membre 24 356 messages
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il y a 12 minutes, shyiro a dit :

Je suis athée ... je ne parle pas de hierarchie, ni meme de complexité, mais du nb d'heterogenité des matieres dans un organisme ... Comme je l'ai dejà dit : il suffit de ragarder et meme couper en deux un maïs et un poulet, pour constater que la matiere constituant le maïs a beaucoup moins d'heterogeneité que la matiere constituant le poulet, non ? Et c'est une realité, pas une croyance, non ?

Mais que sais-tu des interactions entre les molécules complexes du monde végétal ?

 Il ne faut pas se fier à la complexité apparente des divers organes. La preuve le rosier a un génome un peu plus complexe que le génome humain !

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