Problème de python

Bonjour,

J'ai un petit problème de Python (le langage informatique, pas le serpent ^^)

Je dois écrire un programme pour aligner des séquences d'ADN grâce à Numpy, donc en utilisant les matrices.

A un moment, j'essaye de récupérer dans un tuple une valeur de la matrice (qui est une matrice contenant des tuples), donc je fais (positiony, positionx) = B[lignedepart, colonnedepart]

(positiony c'est la position de la ligne donc un chiffre contenu dans le tuple qui m'intéresse dans la matrice B, positionx la position de la colonne, B la matrice qui contient les tuples, lignedepart et colonnedepart c'est la position du tuple qui m'intéresse dans la matrice B)

Et là, ça me dit "TypeError: 'NoneType' object is not iterable"

WTF ? Qu'est-ce qu'un NoneType object ? Qu'est-ce que c'est not iterable (pas la traduction hein, mais à quoi ça correspond) ?

Si quelqu'un de doué en informatique pourrait m'aider, ça serait très gentil. S'il faut le reste du code pour comprendre le problème, je peux l'envoyer en mp. (C'est assez long)

Merci ^^

PS : je tient a préciser que je ne suis pas dans une école d'informatique, donc le code est peut-être moche, pas clair, pas optimisé et tout, mais l'essentiel c'est juste que ça marche. Or là ça ne marche pas T_T

Je connais pas Python mais pteitre t'as tout simplement pas déclaré B.

désolée, je suis incapable de te répondre - mais je suis soulagée, en lisant le titre j'ai cru que tu avais un NAC

bon courage

Non non, B est bien déclarée.

Un NAC ??

oui un Nouvel Animal de Compagnie c'est pourça que ton topic m'a interpellée mais comme il n'en est rien, je te souhaite bonne continuation et bonne soirée

Ah ok (mais pourquoi j'aurais posté dans "aide aux devoirs" si c'était un animal de compagnie ?)

Bon, je trouve toujours pas la solution. J'essaye de bidouiller, mais il me met toujours une erreur avec un NoneType object dedans...

Bonne soirée à toi aussi.

Bonjour,

J'ai un petit problème de Python (le langage informatique, pas le serpent ^^)

T'as bien fait de préciser :D Je me suis fait eue

Tu peux marquer ton code exactement ? Et ensuite le Traceback ?

Bah je crois avoir trouvé l'erreur, la matrice B n'était pas bien remplie. Du coup, là où il aurait du y avoir un tuple, il y avait "None".

Par contre, j'ai un autre problème >.<

Je ne sais pas si tu connais l'alignement de séquence d'ADN, mais en gros, tu as deux matrices. La matrice de scoring, et la matrice de backtracking. La matrice de scoring contient le score des alignements (plus le score est haut, plus c'est bien) calculé à partir du score des cases adjacentes. Et la matrice de backtracking contient la position d'où on vient dans la matrice de scoring. Car après il faut remonter la matrice en sens invers pour trouver l'alignement.

Et là, quand j'aligne mes séquences, maintenant il me donne un truc. Seulement, au lieu de me donner des lettres (les bases de l'ADN), il me donne des scores (des chiffres quoi).

Là je regarde mon code et tout, et je vois l'erreur : au lieu de prendre une lettre, je prenais le score correspondant à cette lettre.

Alors je rectifie, et cette fois je fais bien attention de prendre dans la chaine de caractère à aligner, et non dans la matrice. Et IL ME RETOURNE ENCORE DES SCORES T_T

(Si tu veux je t'envoie le code par mp)

cette fois je fais bien attention de prendre dans la chaine de caractère à aligner, et non dans la matrice. Et IL ME RETOURNE ENCORE DES SCORES T_T

Question très con mais t'as bien recompilé :$

(Si tu veux je t'envoie le code par mp)

J'ai regardé ce que tu m'as envoyé mais n'ayant jamais codé en Python et ne connaissant pas ces histoires d'ADN je vais pas réussir à t'aider :/

Euh recompilé ? Je sais pas ce que ça veut dire (je suis pas en école d'informatique hein ^^). Mais j'ai sauvegarder et j'ai relancer le truc, comme je fais d'habitude.

Mais là, j'ai réussi à rectifier cette erreur. Donc là ça marche en alignement global. Maintenant j'ai des erreurs en alignement local >.>

(Ah juste pour dire, normalement ça devait faire 90 lignes de code. Moi j'ai 185 lignes...)

Ok, pas grave, merci quand même ^^

Problèmes résolus, merci quand même ^^

Alors ça venait d'où ?

Des erreurs par ci par là, par exemple le slicing était pas au bon endroit, du coup il me prenait pas la bonne lettre, de trucs du genre. Enfin c'est bon, c'est résolu.

Bravo !