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Note : - - - - - L'emergence de la vie Abiogenese ou l'impossible devenu realite?

26 janvier 2010 - 19:08 #21

0
on sort du débat non ???
Perso question biologie (ou je ne sais quoi...) suis largué là ... :blush:

Par contre, pour le moment, je pense qu'avant d'entrer dans les considération détaillée des exemple, il serait approprié d'argumenter le raisonnement logique que j'ai dénoncé comme faux... Enfin bon...
Peut être me trompé-je ...

Mais je ne pense pas... (oui... ce serait bête de penser qu'on a tort nan ?? ... enfin.. j'arrête :coeur:)

L'utilisateur est hors-ligne Mad_World
Couillon de service - Ozone, 26 ans


À l'Instant

26 janvier 2010 - 19:12 #22

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Voir le messageMad_World, le lundi 25 janvier 2010 à 14h48, dit :

C'est exactement cela que je conteste, mais la contestation porte sur un point très focaliser de ta phrase : le mot "PREUVE". Une probabilité ne débouche JAMAIS sur une preuve.

...

Voir le messageMad_World, le lundi 25 janvier 2010 à 14h48, dit :

Oui, mais une réalité physique peut être liée à un modèle par des considérations probabilistes... tout simplement parce qu'une partie de la physique est aléatoire... C'est le cas de la MQ. Il n'est pas question de prévoir quoique ce soit de manière exacte (pas de déterminisme en somme). Il est simplement question de dire par exemple : "Si je prends un seul et unique atome excité, quand se désexitera-t-il ?" La probabilité pure nous indique que le phénomène étant aléatoire, nous ne pouvons pas le prédire. Par contre, il est possible en effet de poser une limite en disant : "en dessous de ce seuil de probabilité, je considère qu'il se désexcite instantanément, même si ce n'est pas le cas". Il ne s'agit que d'une hypothèse de travail nécessaire pour supprimer une variable trop aléatoire. On réduit l'espace de cette variable pour des considérations pratiques, sans jamais oublier que ce rétrécissement est tout à fait artificiel, et que dans certains cas il ne sera pas valide.

Dans le cas présent, ce rétrécissement, tu le détournes complètement car tu lui retire son caractère artificiel pour le proposer comme preuve. C'est cela que je mets en avant. Je n'ai pas grand chose à redire de tes calculs et de tes sources, mais tu va trop vite en besogne quand tu conclus.

Tu utilises le terme "preuve" dans un sens mathematique ou proche tandis que j'utilise dans un sens scientifique. En math, il est possible de prouver quelque chose de maniere absolue. Ce n'est toutefois pas le cas en biologie, en physique, etc.. En science, les "preuves" sont conditionnees aux limites des experiences (elles acceptent certain intervales de tolerances par exemple). Elles ne peuvent etre absolues. C'est dans un sens encore plus large que j'utilise le mots "preuve" puisque l'abiogenese est une science historique (et donc pas soumise au meme niveau d'exigence que les sciences operationnelles).

L'utilisateur est hors-ligne kyrilluk
Anarchiste épistémologique, 38 ans


27 janvier 2010 - 13:01 #23

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Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h52, dit :

@Uno/Gaelic:
Je n'ai pas l'intention de repondre aux provocations ou aux arguments deja refutees. Par contre, comme promis, voici ma reponse par rapport a l'hypothese du "Monde RNA":

:blush:

Attends ça vient d'un comique comme toi qui disait ceci : Voui, ben voyons (et un copie colle-wiki, un!!). Bon deja, LUCA, comme son nom l'indique est bien la recherche de la Proto-cellule.

On t'a déjà que tu as tout faut que LUCA ≠ Proto-cellule, c'est fou ce que tu as réfuté cela et c'est fou comme on te provoque lorsqu'on rappelle à toi et à ton noble postérieur que vous avez tout faux! :coeur:

Idem pour ton histoire de 250 protéines/gènes comme minium syndical et donc comme argument à l'encontre de la possibilité de l'abiogenèse, une connerie qui se basait sur ton incapacité à capter l'article que tu citais toi-même comme source ainsi que sur ton ignorance crasse, mais bon remarque, c'est ton habitude!

Ici tu récidives à coup de déductions probabilistes sensé démontrer l'impossibilité de l'abiogenèse, et cela bien sûr en prenant soin là encore d'ignorer ce que l'on t'a déjà expliqué, tu ne discute pas tu trolles!

Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h52, dit :

LE MONDE ARN :

L'idee maitresse de ces theories c'est que la vie sur terre etait basee sur la RNA et que l'ADN est venue bien plutard. L'argument principale est que certaines molecules de RNA possedent certaines proprietees catalytiques que l'on retrouve parmi les proteines ainsi que la fonction que remplie l'ADN (transporter et conserver l'information genetique).
Au depart, une molecule de RNA aurait « surgit » d'une soupe primitive grace a la rencontre fortuite de nucleotides, de sucres et de phosphates dans la soupe prebiotique. Ensuite, parce que cette RNA pouvait se reproduire (et jouer le role de « replicateur »), la selection naturelle a pris le relais et a augmenter de manière graduelle la complexite de ce système RNA primitif pour finir par une cellule. Dans le meme temps, une membrane extremement simple, capable elle aussi de s'auto-reproduire, protegeait cette extraordinaire molecule de RNA ainsi que quelques amino acides provenant de la soupe prebiotique.
SEULEMENT CETTE THEORIE A DE SERIEUX PROBLEMES :
-Probleme avec la production des nucleotides et de la ribose :
Tout d'abord, avant que la molecule de RNA puisse « surgir » il faut déjà que les constituants puissent etre abondament present dans la soupe primitive. Or comme le montre Shapiro (1) il est extrement difficile voir impossible de synthesiser et de maintenir ces elements (notament la ribose). En faite, contrairement aux amino acides (voir l'experience de stanley Miller) aucun de ces elements ne surgissent a la suite de decharges electriques ou via d'autres moyens tel que les pluies de meteorites. D'autre part, meme si un tel processus existait, il reste le probleme de leur longetivitees. Enfin, un environement riche en Nitrogen (necessaire a la formation des nucleotides) empeche la formation du ribose. Ce qui est domage etant donne que la ribose ainsi que les nucleotides sont necessaires a la formation de la RNA. Mais bon, admetons.
-Probleme avec la stabilite des RNA :
Les molecules d'ARN sont chimiquement instables et à moins d'etre protégés par une couche de protéines, se décomposent beaucoup plus facilement l'ADN ou les protéines. Il est difficile de voir comment un monde de l'ARN aurait survécu aux déprédations dues aux événements chimiques aléatoires et etre suffisament stable pour que le processus d'évolution puisse être maintenu. Mais bon admetons.

Non elle n'aurait pas «surgit» bougre de Kyrilluk, elle se serait formé, déjà emploie les mots appropriés ensuite non là encore il n'y aurait pas eu formation d'un ARN comme ça d'un coup, non car ça c'est venue après l'ARN aurait en fait évolué, en fait tu t'en serais peut être douté si tu ne passais pas ton temps à jouer au troll et que tu prenais soin de lire et de capter ce que les autres t'expliquent! :snif:

En effet les membranes très simples se serait en fait formé avant l'ARN qui lui se serait formé et/ou aurait évolué au sein de ces membranes! Ces membranes s'étant initialement formé à partir de simples acides gras, ces membranes qui au départ aurait donc abrité des polymères, les nucléotides passant au travers de la membrane, se polymérisant à l'intérieur, le polymère étant trop gros pour ressortir de la vésicule, c'est le modèle de la proto-cellule dans sa plus simple forme! Notons que récemment une expérience a confirmé une des prédictions de ce modèle explicatifs en matière de formation de membranes simples à partir d'acides gras! Ce dernier point nous allons le voir explique en quoi les affirmations probabilistes sur la formation de l'ARN pour soutenir l'impossibilité de l'abiogenèse, ne tient pas, mais tout d'abord revenons sur la question de la formation des composant de l'ARN à savoir notamment les nucléotides et le ribose!

Ben oui l'argument selon lequel la synthèse n'est pas évidente et donc selon les créationnistes qu'il a donc fallut l'intervention d'un grand barbu qui n'avait rien de mieux à foutre de sa journée, ne tient pas! Pourquoi ben parce que tout d'abord il est important de noter qu'avant l'apparition de la vie la terre devait abriter divers environnements, tout comme aujourd'hui, c'est d'ailleurs là une des difficultés en matière de recherche sur l'abiogenèse, à savoir expérimenté dans le plus de conditions possibles, pouvant se rapprocher des divers conditions environnementales qui ont pu exister à l'époque! Et ensuite parce qu'il faut te mettre à jour mon tout petit Kyrillukounet d'amour, récemment de nouvelles expériences sont finalement parvenues à synthétiser les composants en question!

Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in prebiotically plausible conditions

Enfin note sur la formation et la stabilité de l'ARN, encore une fois celle-ci se serait formé directement dans une proto-cellule dont le contenu initiale n'était que de très simple polymère qui ont donc évolués graduellement, ainsi la vie n'aurait pas commencé avec de gros ARN déjà passablement complexes nageant en milieu libre, l'ARN se serait formé graduellement et aurait dés le départ subit un processus sélectif éliminant les exemplaire les moins stables n'assurant pas comme il se doit la survit de la proto-cellule par apport aux autres plus performantes! Ces nouveaux modèles expliquant comment des structures complexes capable d'activité catalytique ont pu apparaitre puisqu'alors nous sommes déjà dans un paradigme évolutif!

Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h52, dit :

-Ou il faut encore invoquer une chance enorme pour expliquer l'origine du code genetique :
Meme si les deux problemes cites plus haut sont resolus, on arrive au meme probleme qu'avec celui de l'emergence d'une proteine par hasard. Il n'existe aucune molecule d'ARN capable de s'auto-repliquer completement. En laboratoire, a la suite d'un protocole experimentale complexe, des chercheurs ont reussi a produire un molecule de RNA capable de produire une copie d'elle-même (en faite elle a reussi a copier seulement 10%). Chose significative, cette molecule capable de s'auto-repliquee de manière partiale était l'une des seules a avoir cette proprietee parmi un echantillon de 10^15 autres molecules de RNA ! En d'autre terme, il s'agit d'un evenement extremement rare meme dans des conditions idéales. Par ailleurs, cette molecule de RNA necessite 189 nucleides (ce qui correspond a 4^189 possibilitees ou 10^113 possibilitees) et afin de copier entierement et avec le mimimum d'erreur possible, il lui faut une autre molecule d'ARN, possedant une sequence de nucleotide complementaire. En d'autre terme, l'on en revient au meme probleme dont j'ai parler precedement. Exceptee qu'au lieu d'avoir a une proteine ayant « surgit » d'une soupe prebiotique, on a une RNA.

Conclusion:

Il y a bien d'autres problemes lies a cette hypothese (comme le faite que l'ARN ne possede pas une capacite suffisante de catalysme) mais il est déjà claire que non seulement cette hypothese se base sur un « monde » n'ayant probablement jamais existee (permetant la synthese en grande quantites de tous les elements necessaires a la creation d'une molecule de RNA), sur des molecules n'existant pas a l'etat naturelle (la synthese des constituants et des molecules d'ARN est compliquee et necessite l'actions constante des experimenteurs afin d'enlever les byproducs nocif pour ces memes molecules) et sur des probabilitees similaires a celles discutees plutôt.

:bo:

Putain tu tiens vraiment à passer pour un gros relou qui ne lis pas ce que les autres écrivent voilà à présent que tu nous ressorts le coup du problème de la protéine qui émerge par hasard version apparition d'ARN capable de se répliquer, bon sang, et après tu pleurniches en disant qu'on te provoque, tu es toujours aussi comique il n'y a pas à dire! :bo:

Bon au moins tu as lâché ton histoire de 250 protéines minimale, hein?! Ca fera déjà au moins une connerie que tu auras laissée tomber!

Blague à part tu te doutes bien que ce que les inconnus et difficultés concernant les modèles initiaux du « monde ARN » ne sont pas neufs, le trucs c'est que tu part en couille en nous ressortant le coup des probabilité en omettant justement que les récents modèles ne stipulent justement pas qu'il y ait eu ce genre d'événements hautement improbables là encore si tu lisais les posts des autres plutôt que de pleurnicher en affirmant qu'on te provoque tu le remarquerais immédiatement!

Car encore une fois comme je l'ai déjà mentionné précédemment il n'est pas question d'ARN complexe ayant surgit par hasard mais d'ARN ayant évolué, comme déjà dit nous aurions commencé avec de simple proto-cellule animées en leur sein de simples polymérisation de nucléotides! Oui car lorsque les chercheurs remarque les difficultés du Monde ARN il ne s'arrête pas à celui-ci en disant Ah ben il y eu un événement d'une chance incroyable non ils continuent les recherches avec de nouveaux modèles et de nouvelles expériences à l'appuis! Bref au début nous avons des polymères, l'évolution de ces polymères en ARN s'étant justement fait par sélection des polymères ayant la plus grande et la plus avantageuse activité catalytique, cela nous menant justement à l'ARN! Une fois que l'ARN a évolué dans ces proto-cellule l'apparition de ribozymes peut se faire là encore par évolution car les ribozymes ont alors une activité catalytique qui peut justement servir, les premiers ribozymes n'ont même pas à synthétiser eux-mêmes des acides animés mais par exemple simplement à «capter» ceux présent dans l'environnement et à les «attacher» ensemble ce qui provoque la formation de peptides, ces derniers étant initialement courts mais donc on devine ensuite comment tout cela peut évoluer pour à terme former des ribosomes et des protéines, bref avec à terme ce qu'il faut pour l'établissement d'un code génétique à base d'ADN. Mais donc ainsi nous sommes là dans un paradigme évolutif à savoir que nous ne partons pas directement d'un ARN capable de s'auto-répliquer, mais de simple «système » de polymérisation, puis à partir de celui-ci l'apparition d'ARN à proprement parler avec évolution d'une activité catalytique avec notamment l'apparition de ribozymes capables de lier les acides aminés environnants pour former des peptides!

1. Formation de vésicule (proto-membrane)
Image IPB

2. Nucléotide entrant dans la vésicule
Image IPB

3. Polymérisations des nucléotides entrant (proto-cellule)
Image IPB

4. Complexification des polymères
Image IPB

5. naissance de propriétés catalytique => ARN
Image IPB

6. Formation de ribozymes
Image IPB

7. Complexification des ribozymes, sélection de ceux qui produisent les peptides les plus utiles
Image IPB

8. L'ARN continue sa complexification avec l'émergence de nouvelles structures dont certaines mèneront aux ribosomes
Image IPB

Conclusion :

Tes affirmations probabilistes sont à se rouler parterre mon tout petit Kyrillukounet d'amour, en effet après t'être rendu compte que ton histoire de protéine qui «surgit» de la soupe prébiotique n'était qu'un pitoyable Homme de paille nous refait le même coup avec l'ARN autoréplicant qui aurait lui aussi «surgit» de la soupe prébiotique en ignorant là encore les modèles récents en matière de formation de proto-cellules et de formation d'ARN avec propriété catalytique, bordel c'est à se demande si tu t'informes ailleurs que sur les sites poubelles du Discovery Institut et compagnie où même si tu t'informes tout court! :bo:

M'enfin comprendre comment l'abiogenèse s'est produit n'est pas aisé pourtant des progrès ont été fait et les indices existent, les actuelles recherches et théories ne stipulant justement pas des conneries du type il y a eu un événement aussi improbable que l'agencement d'une calculatrice à partir des pièce détachés secouées dans un mixer, mais au contraire l'agencement de premières structures reproductrices à partir de simples phénomènes physiques et chimiques puis évolution de celles-ci avec à la clef apparition de métabolismes primitifs basées sur l'ARN dont les structures actuelles telle que l'ARNm et les ribosomes sont les héritages! :coeur:

Références utiles:

Günter Weberndorfer, Ivo L. Hofacker and Peter F. Stadler, (2002) On the Evolution of Primitive Genetic Codes
Chrisantha Fernando, Gunter Von Kiedrowski, Eors Szathmary (2006) A Stochastic Model of Nonenzymatic Nucleic Acid Replication: ¿¿Elongators'' Sequester Replicators, Journal of Molecular Evolution 2007

Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 20h05, dit :

Dans les cellules prokaryotes le bilan informationel d'une gene et de sa proteine est presque identique. C'est la raison pour laquelle l'on peut modeliser l'emergence du code genetique en utilisant les proteines plutot que l'ADN.
Maintenant, Gaelic a raison si l'on parle de cellules Eukariotes. Cependant, etant donne que les cellules prokariotes sont censee etre les ancetres des cellules eukariotes et plus simple, il est raisonnable d'utiliser cette hypothese.

Ton article ne parlais pourtant pas de 250 gènes mais de 250 protéines, de toute manière cela ne change absolument rien qu'en au fait que le minimum en protéines (et en gènes) dont il était question dans l'article concernait donc des cellules modernes, c'est-à-dire que ce minimum a été calculé par apport au fonctionnement biochimique des organismes modernes (avec ce que cela implique comme contraintes), et donc cela ne signifie pas que les proto-cellules devaient avoir eux aussi le minimum requis pour les organismes modernes!

J'espère que là tu as pigé la nuance et que tu as aussi bien relu l'article auquel tu te référais, hein parce que sinon c'est grave! :)

Tient au fait j'attends toujours que tu retrouves tes couilles mon Kyrillukounet d'amour pour enfin venir justifier tes propos sur Archaeoptéryx dans ton propre topic!

Ce message a été modifié par uno - 27 janvier 2010 - 13:21.

L'utilisateur est hors-ligne uno
Forumeur alchimiste, 29 ans


27 janvier 2010 - 13:24 #24

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Voir le messageuno, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h01, dit :

Ton article ne parlais pourtant pas de 250 gènes mais de 250 protéines, de toute manière cela ne change absolument rien qu'en au fait que le minimum en protéines (et en gènes) dont il était question dans l'article concernait donc des cellules modernes, c'est-à-dire que ce minimum a été calculé par apport au fonctionnement biochimique des organismes modernes (avec ce que cela implique comme contraintes), et donc cela ne signifie pas que les proto-cellules devaient avoir eux aussi le minimum requis pour les organismes modernes!

J'espère que là tu as pigé la nuance et que tu as aussi bien relu l'article auquel tu te référais, hein parce que sinon c'est grave! :blush:

Je repond rapidement a ca vu que tu n'as toujours pas captee.

PREMIEREMENT (et c'est la derniere fois que je l'ecris): Le nombre minimale pour une cellule primitive de pouvoir se reproduire est entre 250 et 500.
C'est ce que montre ces articles dans les journaux "peer reviewed":
1) Gil, R., Silva, F. J., Pereto, J., et al 2004. Determination of the core of a minimal bacterial gene set. Microbiol Mol Biol Rev, 3 (68):518-37
2)Koonin, E. V. 2003E. Comparative genomics, minimal gene-sets and the last universal common ancestor. Nat Rev Microbiol, 2 (1):127-36
3)AISAKA KAZUO 2003 Searching for the minimum gene set.Kagaku to Seibutsu,41 725-726
Voici un extrais:
A discussion is presented on the question: how many genes an organism needs to live independently. A classification of essential genes by function showed that about 50% of them were related to genetic information processes: DNA metabolism (27), RNA metabolism (14), and protein synthesis (95). The minimum gene set was deemed to be a value dependent not only on growth environment but also on phylogeny of microorganisms. Koonin showed that only 80 genes of the 256 in the initial minimum gene sets were conserved commonly among 21 various organisms for which total genomes had been clarified. A table for glance was given, which gives the total numbers of ORFs, the numbers of essential ORFs, the essential ratioes, and the research methods for seven different kinds of microorganisms (Mycoplasma genitalium, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Staphylococcus aureus and so on).
Une cellule ne peut absolument pas se reproduire et conduire ses autres fonctions sans ce nombres minimum de proteines.

DEUXIEMENT: Tu perds ton temps a essayer prouver qu'il y aurait put avoir moins de proteines dans une cellule et neamoins permettre a la cellule de se reproduire. Je te signale que je n'ai pas calculer la probabilite d'obtenir ces 250 proteines!!! J'ai calculer l'obtention d'UNE SEULE proteine. Donc la encore, tu demontres que tu piges que dalle.

A suivre....

Ce message a été modifié par kyrilluk - 27 janvier 2010 - 13:25.

L'utilisateur est hors-ligne kyrilluk
Anarchiste épistémologique, 38 ans


27 janvier 2010 - 13:43 #25

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Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h12, dit :

Tu utilises le terme "preuve" dans un sens mathematique ou proche tandis que j'utilise dans un sens scientifique.


Et pourtant, tu fais des math (probabilités)
...
De plus, le jour les mathématiques ne seront plus une science j'aimerai ne plus être de ce monde...

Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h12, dit :

En math, il est possible de prouver quelque chose de maniere absolue. Ce n'est toutefois pas le cas en biologie, en physique, etc..


Si, c'est tout à fait possible. D'ailleurs, c'est le cas : exemple : comportement mécanique non linéaire d'un matériau granulaire type roche, béton...
Nous avons la preuve que ce comportement n'est pas linéaire. De manière absolue.


Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h12, dit :

En science, les "preuves" sont conditionnees aux limites des experiences (elles acceptent certain intervales de tolerances par exemple). Elles ne peuvent etre absolues.


Faux. C'est le modèle qui contient les notions de conditions aux limites. Les modèles doivent les intégrer. Ce ne sont pas les preuves qui contiennent ces notions... Un preuve est absolue. Par définissions.

Voir le messagekyrilluk, le mardi 26 janvier 2010 à 19h12, dit :

C'est dans un sens encore plus large que j'utilise le mots "preuve" puisque l'abiogenese est une science historique (et donc pas soumise au meme niveau d'exigence que les sciences operationnelles).


Donc tu emploies un terme de manière inappropriée ?????

On fait de la science ou on en fait pas, mais on ne mélange pas tout. Qu'elle soit historique ou non, la science a des méthodes et quand tu dit que tu démontres ou prouve l'existence de Dieu (en bref...), dans ta conception des choses si je comprends bien, tu admets que ta preuve admet une marge d'erreur.

Donc... ce que tu fais :
Tu démontres quelque chose en disant qu'il y a des chances pour que ta démonstration soit fausse...

Ce n'est pas une démarche scientifique. Propose un modèle, défini ses limites et les conditions aux limites. Si tu proposes un modèle cohérent, tu pourra dire avoir démontré quelque chose, dans CE modèle (notes que c'est le modèle qui comporte la notion de "non absolu", pas la preuve...).
Ensuite, nous discuteront de l'applicabilité de ton modèle au cas de figure qui nous intéresse...

C'est pas gagné... Mais c'est une méthode scientifique.

Si tu n'applique pas de méthode scientifique, tu ne peux prétendre faire de la science, et encore moins détourner à ton avantage la définission de terme scientifique (comme "preuve") et d'outils mathématiques (comme les probabilités).

Dans la mesure où sans démarche scientifique, tu ne pourrais prétendre à cela, tout ce que tu as écrit passe de l'état de réflexion à celui d'affirmation sans fondement...

Ce message a été modifié par Mad_World - 27 janvier 2010 - 13:45.

L'utilisateur est hors-ligne Mad_World
Couillon de service - Ozone, 26 ans


27 janvier 2010 - 13:52 #26

0

Voir le messagekyrilluk, le mercredi 27 janvier 2010 à 14h24, dit :

Je repond rapidement a ca vu que tu n'as toujours pas captee.

:blush:

Un conseil va vite enfiler un costume de clown et plus précisément un costume de bouffon il y a urgence mon tout petit Kyrillukounet d'amour! :coeur:

Voir le messagekyrilluk, le mercredi 27 janvier 2010 à 14h24, dit :

PREMIEREMENT (et c'est la derniere fois que je l'ecris): Le nombre minimale pour une cellule primitive de pouvoir se reproduire est entre 250 et 500.
C'est ce que montre ces articles dans les journaux "peer reviewed":
1) Gil, R., Silva, F. J., Pereto, J., et al 2004. Determination of the core of a minimal bacterial gene set. Microbiol Mol Biol Rev, 3 (68):518-37
2)Koonin, E. V. 2003E. Comparative genomics, minimal gene-sets and the last universal common ancestor. Nat Rev Microbiol, 2 (1):127-36
3)AISAKA KAZUO 2003 Searching for the minimum gene set.Kagaku to Seibutsu,41 725-726
Voici un extrais:
A discussion is presented on the question: how many genes an organism needs to live independently. A classification of essential genes by function showed that about 50% of them were related to genetic information processes: DNA metabolism (27), RNA metabolism (14), and protein synthesis (95). The minimum gene set was deemed to be a value dependent not only on growth environment but also on phylogeny of microorganisms. Koonin showed that only 80 genes of the 256 in the initial minimum gene sets were conserved commonly among 21 various organisms for which total genomes had been clarified. A table for glance was given, which gives the total numbers of ORFs, the numbers of essential ORFs, the essential ratioes, and the research methods for seven different kinds of microorganisms (Mycoplasma genitalium, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Staphylococcus aureus and so on).
Une cellule ne peut absolument pas se reproduire et conduire ses autres fonctions sans ce nombres minimum de proteines.

Bref tu prouves que tu ne maîtrises absoluemnt pas le sujet mon microscopique Kyrillukounet d'amour! Le minimum dont il est question ici concerne encore une fois des organismes modernes déjà évolués avec notamment un génome d'ADN, chose qui justement ne devait pas concerné les proto-cellules! Tu piges?!

Mais lorsqu'on lit le titre d'une de tes études on captes bien la chose puisque le titre est Comparative genomics, minimal gene-sets and the last universal common ancestor, bref il est question du minimum de gènes à partir du dernier ancêtres commun, c'est-à-dire chez des organismes déjà évolués avec un génome d'ADN et un métabolisme déjà complexifiée, il n'est pas question des proto-cellules (LUCA ≠ Proto-cellule, souvient toi)! Cela figurait d'ailleurs dans l'article que tu avais initialement toi même posté tu te souviens?!

Les six généticiens et les biologistes cellulaires dans le panneau numéro I sont arrivés à un consensus sur la plus petite taille susceptibles d'être atteintes par des organismes de complexité biochimique moderne.

Taille minimale déduite à partir du nombre minimale de protéines mais donc concernant des organismes à complexité biochimique moderne avec génome d'ADN le même article précisant! par la suite ceci!

Le panneau 4 suggéré que les micro-organismes primitifs reposant sur un système unique de polymères peuvent être aussi petits qu'une sphère de 50 nm de diamètre.

Cela est confirmé par le présent article que tu cites puisqu'alors le minimum de gènes est déduit à partir de l'observation et de l'étude d'organismes modernes tel que Mycoplasma genitalium, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Staphylococcus aureus, ce qui peut permettre des analyses phylogénétiques permettant de se faire une idée sur ce à quoi devait ressembler LUCA et quel pouvait par exemple être le minimum de complexité de celui-ci, mais donc cela ne constitue pas un modèle de proto-cellules et de la complexité minimale qui pouvait caractériser ces dernières, sachant que celles-ci n'ont pas commencé avec des génome d'ADN, et donc certainement pas avec 256 gène d'ADN, putain! :coeur:

D'ailleurs la preuve les études et modèles portant sur l'apparition et l'Evolution des proto-cellules ne se basent pas sur les minimas calculés pour des organismes à complexité biochimique modernes déjà hautement évolués et constitutés d'un génome d'ADN!

Quand tu auras capté la différence entre la détermination du minimum syndicale nécessaire pour des organisme à complexité biochimique moderne avec génome d'ADN et tout et tout, et les modèle de proto-cellules dont le monde de fonctionnement se basait sur des polymère puis de l'ARN, peut être que tu ne passera plus pour un gugus gravement limité sur le plan intellectuel mais d'ici là c'est bien ce dont tu as l'air mon tout petit Kyrillukounet d'amour! :snif:

Voir le messagekyrilluk, le mercredi 27 janvier 2010 à 14h24, dit :

DEUXIEMENT: Tu perds ton temps a essayer prouver qu'il y aurait put avoir moins de proteines dans une cellule et neamoins permettre a la cellule de se reproduire. Je te signale que je n'ai pas calculer la probabilite d'obtenir ces 250 proteines!!! J'ai calculer l'obtention d'UNE SEULE proteine. Donc la encore, tu demontres que tu piges que dalle.

A suivre....

Tu tiens vraiment à passer pour une pauvre cloche, mais bon c'est ton habitude que de passer pour une pauvre cloche en répétant en boucle les mêmes bêtises sans tenir compte de ce qu'on t'explique! :bo:

Justement dans les modèles d'abiogenèse il n'est pas question de protéines se formant comme ça d'un coup par chance aussi tes calculs probabilistes tel que tu les présentes sont inutiles car totalement à côté de la plaque, c'est ce qu'on te répètes ici depuis le début mais tu n'en tient pas compte comme tout bon troll tu ignores ce qu'on t'explique pour répéter en boucle les mêmes conneries! Ce que tu prouve ici de manière flagrante! :bo:

Ah oui ramasse tes petites couille mon Kyrillukounet d'amour!

Ce message a été modifié par uno - 27 janvier 2010 - 20:26.

L'utilisateur est hors-ligne uno
Forumeur alchimiste, 29 ans


27 janvier 2010 - 14:09 #27

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J'adore vos petit mots d'amour en chinois les gars.... :blush:

/me sort

L'utilisateur est hors-ligne Mad_World
Couillon de service - Ozone, 26 ans


27 janvier 2010 - 14:15 #28

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moi perso je capte pas grand chose mais j'adore ce duel !!!

ex_enna*


27 janvier 2010 - 16:49 #29

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Uno, decidement tu t'enfonces grave.

Voir le messageuno, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h01, dit :

Pourquoi ben parce que tout d’abord il est important de noter qu’avant l’apparition de la vie la terre devait abriter divers environnements, tout comme aujourd’hui, c’est d’ailleurs là une des difficultés en matière de recherche sur l’abiogenèse, à savoir expérimenté dans le plus de conditions possibles, pouvant se rapprocher des divers conditions environnementales qui ont pu exister à l’époque! Et ensuite parce qu’il faut te mettre à jour mon tout petit Kyrillukounet d’amour, récemment de nouvelles expériences sont finalement parvenues à synthétiser les composants en question!

Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in prebiotically plausible conditions

Voici ce que j'ai ecris:

Voir le messagekyrilluk, le mercredi 20 janvier 2010 à 00h47, dit :

SEULEMENT CETTE THEORIE A DE SERIEUX PROBLEMES :
-Probleme avec la production des nucleotides et de la ribose :
Tout d’abord, avant que la molecule de RNA puisse « surgir » il faut déjà que les constituants puissent etre abondament present dans la soupe primitive. Or comme le montre Shapiro (1) il est extrement difficile voir impossible de synthesiser et de maintenir ces elements (notament la ribose). En faite, contrairement aux amino acides (voir l’experience de stanley Miller) aucun de ces elements ne surgissent a la suite de decharges electriques ou via d’autres moyens tel que les pluies de meteorites. D’autre part, meme si un tel processus existait, il reste le probleme de leur longetivitees. Enfin, un environement riche en Nitrogen (necessaire a la formation des nucleotides) empeche la formation du ribose. Ce qui est domage etant donne que la ribose ainsi que les nucleotides sont necessaires a la formation de la RNA. Mais bon, admetons.


Le document en question que tu donnes ne reponds a aucune de ces objections citees plus haut. Au contraire, elles confirment qu'une telle soupe etait tres tres improbable:
1- Les scientifques ont elaborees des procedures complexes qui a aboutit a la synthetisation de 50% des nucleotides necessaires: donc ta declaration selon laquelle les scientifiques auraient "finalement parvenues à synthétiser les composants en question" montre que soit a) tu n'as pas lus l'etude en question ou b) tu n'as rien piger (comme d'habitude).
2- Tu peux etre pardonnee pour croire que cette etude auraient resolus les problemes liee a la production des nucleotides dans la mesure ou les article de presses annoncaient peremptoirement que c'etais le cas. Mais comme dans le cas de Ida (tu n'as pas oublier? Ida: le chaînon manquant dans l'évolution de l'homme, Darwin avait-il raison?) cette annonce est pour le moins hum...prematures. En effet, le seul aspect realiste de l'experience decrite est que les experimentateurs ont fait leur possible pour utiliser des elements qui auraient put exister dans une des different scenario d'une terre primitive. Mais cela s'arrete la. Ils n'ont pas creer une soupe et laisser les nucleoides se former sans intervention humaine par exemple. En faite c'est plutot le contraire: apres avoir obtenu des resultats intermediaires (a partir d'elements purifiees), il a enleve tous les produits issues de ces reactions pouvant reagir avec les futures nucleotides. Non seulement cela mais ces chimistes ont controlle, a chaques stades de leur experience, le PH de leur solution, la longueur d'onde des UV (ainsi que leur frequence- c'est a dire la frequence a laquelle les UV ont ete declanches), la temperature de la solution et tout cela en fonction des reactions chimiques qu'ils desiraient.
La question est evidement: il y x milliards d'annees, lorsque les nucleotides n'existaient pas encore, QUI etait la pour jouer le role du chimiste? Arf!!! :blush:

Voir le messageuno, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h01, dit :

Bref tu prouves que tu ne maîtrises absoluemnt pas le sujet mon microscopique Kyrillukounet d'amour! Le minimum dont il est question ici concerne encore une fois des organismes modernes déjà évolués avec notamment un génome d'ADN, chose qui justement ne devait pas concerné les proto-cellules! Tu piges?!

He, Barbie, va falloire te remettre au valium. Au moins, au lieu d'ecrires des anneries, tu fairais mieux reprendre tes petites pillules roses et continuer a te masturber: ca eviterais de polluer ce topic avec tes commentaires debiles maintes et maintes fois refutes! Une cellule a la propriete de diviser et de se reproduire. Et LUCA, une cellule hypothetique, aurait eu cette proprietee. Imaginer des blogs de lipides, ne possedant aucune de ces proprietees et les appeller "cellules" c'est se foutre du peuple.

Enfin, je sais que pour quelque pour un etudiant en sociologie, ce genre d'histoire peut passer comme etant "scientifique":

Voir le messageuno, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h01, dit :

Enfin note sur la formation et la stabilité de l’ARN, encore une fois celle-ci se serait formé directement dans une proto-cellule dont le contenu initiale n’était que de très simple polymère qui ont donc évolués graduellement, ainsi la vie n’aurait pas commencé avec de gros ARN déjà passablement complexes nageant en milieu libre, l’ARN se serait formé graduellement et aurait dés le départ subit un processus sélectif éliminant les exemplaire les moins stables n’assurant pas comme il se doit la survit de la proto-cellule par apport aux autres plus performantes! Ces nouveaux modèles expliquant comment des structures complexes capable d'activité catalytique ont pu apparaitre puisqu'alors nous sommes déjà dans un paradigme évolutif.

cependant je vais te demander de "quantifier" tes declarations.
1-Quel est la taille minimal de l'ARN auxquel tu te referes lorsque tu ecris: "celle-ci se serait formé directement dans une proto-cellule dont le contenu initiale n’était que de très simple polymère".
2-Est-ce que cette ARN peut se repliquer toute seule?
3-Quel est le lien entre l'existence de cette molecule d'ARN et la survie du "blob" l'entourant et la protegeant?

Voir le messageenna, le mercredi 27 janvier 2010 à 14h15, dit :

moi perso je capte pas grand chose mais j'adore ce duel !!!

Je trouve cela extraordinaire que quelqu'un d'autre que nous puisse en realite lire nos paves! :coeur:

Ce message a été modifié par kyrilluk - 27 janvier 2010 - 21:00.

L'utilisateur est hors-ligne kyrilluk
Anarchiste épistémologique, 38 ans


27 janvier 2010 - 17:03 #30

0

Voir le messageMad_World, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h43, dit :

Si, c'est tout à fait possible. D'ailleurs, c'est le cas : exemple : comportement mécanique non linéaire d'un matériau granulaire type roche, béton...
Nous avons la preuve que ce comportement n'est pas linéaire. De manière absolue.

Non, ce que l'on a ce sont des convergences entre un modele mathematique et des experiences conditionnes par des contraintes (notament de mesurement). Un autre exemple: la mecanique quantique est une theorie physique qui a ete validees avec beaucoup de succes. Les equations de Schroedinger sont lineaires. Et c'est tant mieux, d'un point de vue pratique. Cependant, cela n'est pas la "preuve" que les phenomenes quantiques sont gouverner par des comportements lineaires. En faites, il existe meme des theories quantiques qui utilisent une version non lineaire des equations quantiques (c'est le cas de la Ghirardi-Rimini-Weber theorie) et qui donc ont comme vocation de prendre en compte les memes faits expliquee par la MQ lineaire.

Voir le messageMad_World, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h43, dit :

Un preuve est absolue. Par définissions.

En math mais pas en science. L'eau bout a 100 degree C. On a des preuves de cette affirmations. Mais ces preuves ne sont pas absolues (elles sont sujettes aux limites inherentes des conditions experimentales).

Voir le messageMad_World, le mercredi 27 janvier 2010 à 13h43, dit :

On fait de la science ou on en fait pas, mais on ne mélange pas tout. Qu'elle soit historique ou non, la science a des méthodes et quand tu dit que tu démontres ou prouve l'existence de Dieu (en bref...), dans ta conception des choses si je comprends bien, tu admets que ta preuve admet une marge d'erreur.

Comme pour toutes les sciences (a part les math si l'on considere cela comme une science). Voir l'exemple plus haut avec l'eau bouillante.

Sinon, histoire de faire avancee ce debat interessant, j'aimerais connaitre ta definition (une definition aussi precise que possible) de ce que constitue une science. Quel est la methode que TOUS les scientifiques devraient suivre selon toi?

L'utilisateur est hors-ligne kyrilluk
Anarchiste épistémologique, 38 ans



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